为落实全国科技创新大会、第七次全国环境保护大会和第二次全国环保科技大会精神，面向国家环境保护与管理决策的科技需求，大力提升环保领域的知识创新能力。进一步整合科技创新资源，优先在支撑环境管理战略转型的重点学科领域，高目标、高起点地布局建设重点实验室。到2015年，在涉及当前和今后一段时期国家环保工作的重点领域和学科方向，计划新建成10个左右重点实验室，到2020年，再建成10个左右重点实验室，基本建成与国家环境保护管理决策科技需求相适应的重点实验室体系，形成重点突出、布局合理、规模适度、技术先进、运行高效、良性发展的科研实验平台，成为国家环境保护科研和管理决策的重要支撑。

    重点实验室建设的主要任务是承担国家环境保护基础研究与应用基础研究项目，解决环境保护重大和关键性难题；建设与发展环境科学重点学科和新兴学科，获取原始创新成果和自主知识产权；培养和造就高水平的环境保护学术带头人，培训环境保护科学技术人员；开展环境保护国际合作、学术研讨和专题交流，掌握国内外科学技术发展动向，向环境保护部提供相关领域科技发展报告，向社会提供咨询服务，并开展科学普及活动。

到2020年，在以下重点领域与方向将进行重点实验室的布局： 
　　——水污染防治领域：河流环境模拟与污染控制、地下水环境模拟与污染控制、农村面源污染控制等方向； 
　　——大气污染防治领域：大气复合污染模拟预警与调控、背景大气监测、空气污染预报预警、气溶胶污染控制与模拟、机动车污染控制与模拟、室内空气质量控制与模拟等方向； 
　　——固体废物污染防治与化学品管理领域：固体废物资源化和污染控制、危险废物全过程控制、化学品环境行为模拟等方向； 
　　——生态保护和建设领域：城市生态环境模拟与保护等方向； 
　　——土壤污染防治领域：污染场地土壤污染控制与修复方向； 
　　——环境与健康领域：环境污染健康影响机理机制、环境污染健康影响人群流行病学、环境污染健康影响暴露评价、环境污染健康影响风险评价等方向； 
　　——环境监管技术领域：环境应急监测技术、污染物计量和标样、环境监测质量控制、环境规划与政策情景模拟、数字环境与预警模拟、环境基准和风险控制、环境影响评价等方向； 
　　——核与辐射安全领域：核与电磁辐射污染监测和控制、放射性废物污染控制与模拟等方向； 
　　——全球环境问题研究领域：温室气体污染与控制、跨界河流污染控制等方向； 
　　——其他：环保功能材料研究、重金属污染防治等方向。 
环境保护部2012年12月11日的发文要求各级环境保护部门要重视和支持依托其下属单位建设的重点实验室的各项工作，在人员配备、资金安排、项目布局、科研条件配置等方面，向重点实验室予以倾斜。要大力促进重点实验室协同创新和科技资源共享。各级环境保护部门要积极引导和促进重点实验室的对外开放和协同创新，通过项目合作、学术交流、设立开放基金、设立博士后工作站等，加强重点实验室与国内外研究机构、大专院校的交流与合作，大力提升重点实验室的国际化水平。要建立完善重点实验室科技资源共享机制，通过互联网、专家信息系统等方式，宣传重点实验室的发展动态和科研成果，搭建重点实验室科研条件和科研成果共享平台，促进科技成果的转化以及重大科技基础设施和仪器设备的共享。